Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms