Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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