Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoa5Q8C7G5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoa5Q8C7G5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms