Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stbd1Q8C7E7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stbd1Q8C7E7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms