Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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Ssuh2Q8C3L1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Ssuh2Q8C3L1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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