Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd2Q8BY35 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgd2Q8BY35 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms