Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms