Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp398Q8BV16 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp398Q8BV16 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms