Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp43Q8BUM9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp43Q8BUM9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms