Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms