Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem260Q8BMD6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms