Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms