Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan12Q8BKT6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms