Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcal1Q8BJL0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms