Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI41

Synb, Syncytin-B, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynbQ8BI41 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynbQ8BI41 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms