Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms