Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af1l4Q8BGJ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms