Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krr1Q8BGA5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms