Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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