Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms