Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmtc4Q8BG19 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms