Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms