Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl42Q8BFQ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl42Q8BFQ9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms