Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc172Q810N9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms