Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2bQ80XK6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms