Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms