Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo2Q7TSY8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms