Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms