Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms