Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms