Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms