Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp397Q7TNK4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms