Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms