Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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