Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms