Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GypcQ78HU7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GypcQ78HU7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms