Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stambpl1Q76N33 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stambpl1Q76N33 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stambpl1Q76N33 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms