Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mindy1Q76LS9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mindy1Q76LS9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms