Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspg5Q71M36 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cspg5Q71M36 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspg5Q71M36 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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