Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd3Q6ZQK0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms