Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinlQ6ZQ12 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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