Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms