Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic3Q6X1Y6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic3Q6X1Y6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms