Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms