Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx4Q6RUU0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms