Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnip1Q6QD59 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnip1Q6QD59 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnip1Q6QD59 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnip1Q6QD59 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnip1Q6QD59 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnip1Q6QD59 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms