Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfrkbQ6PIJ4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms