Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms