Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms