Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms